Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AVL9Q8NBF6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms