Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAAF3Q8N9W5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAAF3Q8N9W5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms