Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00269Q8N2A0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms