Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HECW1Q76N89 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECW1Q76N89 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms