Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MFSD6Q6ZSS7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MFSD6Q6ZSS7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms