Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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