Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms