Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM69BQ5VUD6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms