Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRMS1LQ5PSV4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms