Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms