Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms