Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf22Q49AR2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms