Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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LRRC36Q1X8D7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC36Q1X8D7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms