Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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ZNF56Q15929 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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ZNF56Q15929 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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ZNF56Q15929 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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ZNF56Q15929 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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ZNF56Q15929 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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ZNF56Q15929 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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ZNF56Q15929 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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ZNF56Q15929 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF56Q15929 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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