Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN9AQ15858 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SCN9AQ15858 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCN9AQ15858 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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