Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A5Q15758 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms