Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHBQ15464 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHBQ15464 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHBQ15464 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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