Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CKAP5Q14008 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKAP5Q14008 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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