Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms