Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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