Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms