Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms