Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYCNQ0VAF6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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