Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms