Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOX4Q06945 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms