Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALD1Q05682 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms