Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNF85Q03923 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms