Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC6Q03468 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms