Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SDAD1P4-201ENST00000418445 1645 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 TCAIM-208ENST00000444602 1056 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC100861.2-201ENST00000511929 1125 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB1Q02641 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms