Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF17Q02223 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms