Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IFITM3Q01628 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms