Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2P78314 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms