Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRA2BP62995 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TRA2BP62995 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRA2BP62995 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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