Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLTCL1P53675 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLTCL1P53675 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms