Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA4P51532 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms