Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBP50607 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBP50607 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBP50607 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBP50607 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBP50607 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBP50607 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBP50607 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBP50607 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBP50607 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms