Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIP4K2AP48426 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms