Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRATP43155 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRATP43155 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CRATP43155 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms