Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms