Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPC1P35052 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms