Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA3P32297 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA3P32297 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms