Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA9P31269 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms