Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms