Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms