Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms