Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DESP17661 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DESP17661 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DESP17661 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DESP17661 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DESP17661 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DESP17661 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DESP17661 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DESP17661 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DESP17661 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DESP17661 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DESP17661 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DESP17661 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DESP17661 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms