Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH1P12830 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH1P12830 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms