Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms