Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms