Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOA4P06727 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms